Den Mandelgrenska samlingen är systematiserad efter den ordning som Nils Månsson Mandelgren själv skapade. Samlingen är indelad i sex serier och serie 1-3 och 6 är indelad i tolv huvudavdelningar beroende på ämnesområde. I serie 4 och 5 finns huvuddelen av kyrkomaterialet som är indelat efter dåvarande stift, 12 stycken.
Serier
1: Renritningar
2: Fältskisser
3: Anteckningar
4: Bilder, kyrkor
5: Anteckningar, kyrkor
6: Utlandet (bilder)
De tolv avdelningarna för serie 1-3 och 6 har följande ämnesrubriker.
Avdelningar
1: Landets natur och beskaffenhet
2: Folktyper och stamskillnader
3: Näringar och levnadssätt
4: Klädedräkter och smycken
5: Bostäder och husgeråd
6: Slöjd
7: Samfärdsel och varubyte
8: Sjöväsendet
9: Krigsväsendet
10: Rättsväsendet
11: Helgedomar
12: Högtider och folkbruk